Оборудование и диагностические системы Agilent Genomics & Diagnostics (Dako)
Аналитические платформы геномики, молекулярной биологии и патоморфологии Agilent Genomics & Diagnostics: системы электрофореза TapeStation и Fragment Analyzer, станции пробоподготовки NGS SureSelect, микрочипы SurePrint и автоматические иммуногистохимические стейнеры Dako Omnis.
Системы автоматического электрофореза TapeStation 4150 и 4200
Автоматизированные платформы Agilent 4150 и 4200 TapeStation реализуют экспресс-анализ нуклеиновых кислот с использованием сменных картриджей ScreenTape. Системы обеспечивают точное определение размеров фрагментов, концентрации и целостности образцов ДНК и РНК перед секвенированием.
- Готовые микрофлюидные картриджи ScreenTape для анализа ДНК, РНК и геномных образцов
- Автоматический расчет индекса целостности РНК RINe и качества геномной ДНК DIN
- Планшетная загрузка до 96 образцов на платформе 4200 с минимальным ручным трудом
- Анализ одного образца за 1–2 минуты с расходом всего одного микролитра пробы
Системы параллельного капиллярного электрофореза Fragment Analyzer
Многоканальные платформы капиллярного гель-электрофореза Agilent 5200, 5300 и 5400 Fragment Analyzer обеспечивают параллельное разделение фрагментов нуклеиновых кислот. Сменные матричные массивы на 12, 48 и 96 капилляров позволяют масштабировать производительность в геномных центрах.
- Сменные капиллярные массивы на 12, 48 и 96 каналов с длиной капилляров до 55 см
- Автоматизированный расчет метрик целостности RQN для РНК и индекса качества DQN
- Высокая чувствительность детекции протяженных фрагментов геномной ДНК до 50 т.п.н.
- Специализированные количественные и качественные наборы для анализа мРНК и плазмид
Микрофлюидные биоанализаторы Agilent 2100 Bioanalyzer и чипы LabChip
Приборный комплекс Agilent 2100 Bioanalyzer является эталонным микрофлюидным анализатором для автоматического электрофореза нуклеиновых кислот и белков. Прибор использует сменные микрочипы LabChip для количественного и качественного анализа с автоматическим расчетом индекса RIN.
- Микрофлюидная технология LabChip на стеклянных чипах для разделения ДНК, РНК и белков
- Золотой стандарт определения целостности РНК по индексу RNA Integrity Number RIN
- Минимальный объем расхода реагентов и образцов от одного микролитра на анализ
- Программный комплекс 2100 Expert с поддержкой нормативных требований 21 CFR Part 11
ПЦР-амплификаторы реального времени AriaMx и SureCycler
Системы ПЦР реального времени Agilent AriaMx и классические термоциклеры SureCycler обеспечивают точную температурную однородность и быструю оптическую детекцию. Модульная конструкция AriaMx поддерживает до шести сменных светодиодных картриджей для мультиплексного анализа.
- Шестизонный термоблок Пельтье на 96 лунок со скоростью нагрева до шести градусов в секунду
- Модульная оптическая система с независимыми светодиодными картриджами детекции
- Поддержка флуоресцентных красителей SYBR, TaqMan-зондов и HRM-анализа плавления ДНК
- Высокая температурная однородность плюс-минус четыре десятых градуса по всему блоку
Системы таргетного обогащения NGS SureSelect и рабочие станции Magnis
Линейка реагентов Agilent SureSelect XT HS2 и автоматизированные станции Magnis NGS обеспечивают высокоэффективное таргетное обогащение геномных библиотек. Технология гибридизационного захвата оптимизирует покрытие сложных участков генома при исследовании экзомов и онкопанелей.
- Библиотечные наборы SureSelect XT HS2 с молекулярным баркодированием UMB и MBC
- Автоматическая роботизированная станция подготовки библиотек Agilent Magnis NGS
- Комплексные экзомные панели Human All Exon и кастомные таргетные панели проб
- Ферментативная фрагментация для низкоконцентрированных образцов ДНК из FFPE-блоков
Микрочиповые платформы SurePrint и программное обеспечение CytoGenomics
Платформа олигонуклеотидных микрочипов Agilent SurePrint и биоинформатический пакет CytoGenomics обеспечивают высокоразрешающий цитогенетический анализ. Комплекс позволяет надежно детектировать вариации числа копий генов CNV и области потери гетерозиготности при aCGH и SNP-исследованиях.
- Технология синтеза длинных 60-членных олигонуклеотидных зондов SurePrint на стекле
- Объединенный дизайн чипов для одновременного анализа хромосомных CNV и полиморфизмов SNP
- Программный комплекс CytoGenomics со встроенными базами данных ClinVar и DGV
- Высокоточные сканеры микрочипов Agilent SureScan с двухцветной лазерной оптикой
Автоматизированные иммуногистохимические стейнеры Dako Omnis и Link 48
Флагманские иммуногистохимические стейнеры Dako Omnis и Autostainer Link 48 предназначены для автоматизированной окраски гистологических препаратов. Платформы реализуют протоколы ИГХ и гибридизации in situ с непрерывной загрузкой и независимым контролем температуры каждого стекла.
- Одновременное проведение иммуногистохимии ИГХ и гибридизации in situ ISH на борту
- Независимые температурные камеры на 60 стекол с функцией непрерывной дозагрузки
- Интеграция с модулями предварительной подготовки и демаскировки антигенов PT Link
- Совместимость с полимерными системами детекции EnVision FLEX для онкодиагностики
Диагностические антитела, зонды гибридизации ISH и растворы Dako
Диагностическая линейка Agilent Dako охватывает валидированные моноклональные антитела, полимерные системы визуализации EnVision FLEX и флуоресцентные зонды гибридизации in situ. Реагенты оптимизированы для стандартизированной онкоморфологической диагностики биопсийного материала.
- Высокоаффинные первичные антитела Dako для иммуногистохимической верификации опухолей
- Полимерные двухшаговые системы детекции EnVision FLEX с пероксидазным хромогеном DAB
- Зонды флуоресцентной и хромогенной гибридизации in situ для анализа генных амплификаций
- Специализированные буферные растворы демаскировки эпитопов и депарафинизации срезов
Регламентная калибровка и подготовка микрофлюидных картриджей TapeStation ScreenTape
Перед началом серии анализов нуклеиновых кислот на приборах Agilent 4150 и 4200 TapeStation картриджи ScreenTape и флаконы с буферными растворами выдерживают при комнатной температуре не менее тридцати минут.
Обязательна визуальная проверка целостности защитной пленки и отсутствия воздушных пузырьков в капиллярных каналах картриджа. Для образцов с высокой концентрацией соли рекомендуется предварительное разбавление деионизированной водой во избежание искажения электрофоретической подвижности фрагментов.
Программное обеспечение автоматически считывает штрихкод ScreenTape, выполняет тест оптического выравнивания фотодиодной линейки и блокирует запуск при истечении регламентного срока годности используемых гелевых матриц.
Промывка и обслуживание капиллярных массивов анализаторов Fragment Analyzer
Длительная эксплуатация параллельных капиллярных массивов Agilent 5200, 5300 и 5400 Fragment Analyzer требует соблюдения регламента ежедневной очистки и кондиционирования.
После завершения рабочего цикла капилляры погружают в раствор для промывки на основе гидроксида натрия для полного удаления адсорбированных остатков нуклеиновых кислот и интеркалирующих красителей.
Замена гелевой матрицы высокого разрешения выполняется под контролируемым пневматическим давлением с контролем отсутствия газовых микрополостей.
При снижении резкости полос и расхождении внутреннего стандарта подвижности капиллярный блок промывают подогретой деионизированной водой с проверкой токов утечки каждого из параллельных аналитических каналов.
Оптимизация гибридизационного захвата библиотек NGS в системе SureSelect XT HS2
Повышение специфичности таргетного обогащения геномных библиотек с наборами Agilent SureSelect XT HS2 достигается строгим соблюдением температурного профиля термоциклера при температуре шестьдесят пять градусов Цельсия.
Для низкоконцентрированной ДНК из деградированных парафиновых FFPE-блоков критично использование молекулярных баркодов MBC, позволяющих отфильтровать артефакты полимеразной цепной реакции и дубликаты прочтений на биоинформатическом этапе.
Использование магнитных микросфер для отмывки гибридизационных комплексов требует полного удаления этанола перед элюцией, что исключает ингибирование ферментов финальной амплификации и обеспечивает равномерное покрытие целевых экзонных последовательностей.
Контроль температурного профиля и профилактика стейнеров Dako Omnis
Стабильность результатов иммуногистохимического окрашивания и гибридизации in situ на платформе Dako Omnis зависит от точности индивидуальной терморегуляции рабочих модулей.
Ежемесячно проводится проверка контактных нагревательных элементов предметных стекол с использованием калиброванных термодатчиков. Дозирующие роботизированные иглы промываются деконтаминирующими растворами для предотвращения осаждения солей и перекрестного переноса антител между лунками.
Регулярная очистка дренажных емкостей, калибровка оптических датчиков уровня реагентов и замена фильтров деионизированной воды исключают образование артефактов фонового связывания хромогена и гарантируют высокую контрастность морфологических препаратов.
Валидация гибридизации микрочипов SurePrint и настройка лазерных сканеров
Проведение цитогенетических исследований методом сравнительной геномной гибридизации aCGH на слайдах Agilent SurePrint требует применения специализированных ротационных печей гибридизации при сорока пяти оборотах в минуту.
Равномерность перемешивания меченых растворов Cy3 и Cy5 предотвращает краевые градиентные искажения флуоресцентного сигнала. Перед сканированием на платформе SureScan слайды промывают буферами с пониженным содержанием солей и стабилизатором озона для предотвращения деградации красителя Cy5.
Программный пакет CytoGenomics автоматически рассчитывает метрику шума DLRS, надежно оценивая пригодность полученных сканов для выявления микроделеций и дупликаций хромосомных локусов.
Очистка капиллярного тракта и замена электродов биоанализаторов 2100 Bioanalyzer
Поддержание высокой воспроизводимости анализов на микрофлюидных системах Agilent 2100 Bioanalyzer обеспечивается регулярным уходом за картриджным отсеком и платиновыми электродами.
После каждого прогона микрочипа LabChip блок электродов промывают специальным детергентом и деионизированной водой с помощью адаптера очистки для исключения солевых замыканий между каналами. Контактные штыри проверяют на отсутствие механических деформаций и налета красителя.
При появлении базового дрейфа оптического сигнала или снижении показателя целостности РНК RIN электродный картридж извлекают для ультразвуковой очистки в изопропиловом спирте с последующей воздушной продувкой чистым азотом перед установкой.
Оптическая юстировка и калибровка ПЦР-амплификаторов AriaMx
Точность количественного анализа амплификации в реальном времени на платформах Agilent AriaMx поддерживается автоматизированной самодиагностикой оптических узлов.
Перед запуском высокочувствительных протоколов встроенное программное обеспечение тестирует более шестидесяти аппаратных параметров оптических картриджей со светодиодами.
Калибровка оптических путей исключает необходимость добавления референсного пассивного красителя ROX в реакционную смесь, снижая себестоимость единичной реакции.
Проверка плавности перемещения оптической каретки и чистоты защитных кварцевых линз предотвращает искажение базовой линии флуоресценции при мультиплексном генотипировании аллелей.
Демаскировка антигенов в модулях PT Link и стабильность антител Dako
Воспроизводимость иммуногистохимических исследований онкопатологии определяется качеством предварительной термической демаскировки эпитопов в станциях предварительной подготовки Dako PT Link.
Использование специализированных буферов с высоким и низким pH обеспечивает демаскировку ядерных и цитоплазматических маркеров без повреждения тканевой архитектуры парафиновых срезов.
Первичные моноклональные антитела Dako хранят при температуре от двух до восьми градусов Цельсия в защищенных от света емкостях. Исключение циклов замораживания и оттаивания концентрированных антител предотвращает денатурацию белковых глобул и сохраняет специфическую аффинность к антигенам опухоли.
Agilent Genomics & Diagnostics и названия моделей — товарные знаки их правообладателей. Они указаны только для обозначения оборудования, для которого мы подбираем запчасти. Компания SpareX не является официальным дилером, дистрибьютором или представителем Agilent Genomics & Diagnostics и не связана с правообладателем. Происхождение, документы и гарантия указываются по каждой позиции в коммерческом предложении.
Другие производители оборудования
- Оборудование и запчасти Agilent Technologies
- Оборудование и запчасти Agilent CrossLab
- Оборудование и запчасти Agilent Cell Analysis
- Оборудование и запчасти Agilent Spectroscopy
- Оборудование и запчасти Agilent Vacuum Technologies
Документы и источники
- Автоматизированный электрофорез нуклеиновых кислот TapeStation — Краткое руководство пользователя ScreenTape (PDF)
- Капиллярный гель-электрофорез Fragment Analyzer — Аналитический обзор контроля качества нуклеиновых кислот
- Таргетное обогащение библиотек NGS SureSelect — Руководство по пробоподготовке и наборам XT HS2
- Автоматизированное иммуногистохимическое окрашивание Dako Omnis — Руководство по приборным системам ИГХ
- Микрочиповый анализ SurePrint и CytoGenomics — Технический обзор сравнительной геномной гибридизации aCGH
- Реагенты и диагностические антитела Agilent Dako — Каталог продукции для клинической онкопатологии
- Инструменты молекулярной биологии Agilent Genomics — Обзор геномного оборудования и аналитических платформ
- Цифровые комплексы молекулярной патологии Agilent — Информационные системы стандартизации диагностических данных
